Joana (C.) M.
Mitarbeiter | Bioinformatik
Erfahrungen
Mitarbeiter | Bioinformatik
DNA do Brasil
- Führe umfangreiche Genomdatenverarbeitung durch, um ein populationsspezifisches Referenzgenom für Brasilien zu erstellen.
- Identifiziere und annotiere unterrepräsentierte Varianten und mutmaßliche Loss-of-Function-Varianten.
- Arbeite mit interdisziplinären Teams aus Genetikern und Computational-Biologen zusammen.
Data Scientist | Bioinformatik
Leyden Labs
- Entwicklung und Pflege reproduzierbarer Workflows für Einzelzelltranskriptomik und virale Genomanalyse.
- Aufbau und Optimierung von Pipelines für die virale Genomanalyse (Alignment, Variantenbestimmung, Stammidentifikation).
- Integration großer öffentlicher Datensätze in einen Atlas zur Zielentdeckung und Erzeugung umsetzbarer visueller Erkenntnisse für die F&E-Leitung.
- Bereitstellung technischer Dokumentationen, Studienberichte und Visualisierungen für funktionsübergreifende Teams.
Postdoktorand | Bioinformatik
Erasmus MC
- Entwicklung und Bereitstellung reproduzierbarer R-Markdown-Workflows für Karyotypisierung, allelspezifische Expression und Transkriptomik.
- Verarbeitung und Analyse groß angelegter Genomik- und Einzelzell-RNA-Seq-Datensätze für kollaborative Forschungsprojekte.
- Technischer Support für bioinformatische Software, Werkzeuge und NGS-Analysen.
- Erstellung klarer Datenvisualisierungen und Dokumentationen zur Förderung interdisziplinärer Kommunikation.
Postdoktorand | Genomik & Epigenomik
University of São Paulo
- Untersuchung des epigenetischen Zustands des X-Chromosoms in Präimplantations-Embryonen von Menschen und nicht-menschlichen Primaten mittels Einzelzell-RNA-Seq.
- Verbesserung von Pipelines für QC, Mapping, Variantenbestimmung und allelspezifische Genexpressionsanalyse bei Einzelzell-RNA-Seq.
- Fehlerbehebung in bioinformatischen Pipelines und Optimierung von Workflows.
- Betreuung von Doktoranden in bioinformatischen Methoden und Versuchsdesign.
- Veröffentlichung wichtiger Ergebnisse zur X-Chromosomen-Inaktivierung und Dosiskompensation in hochrangigen Fachzeitschriften.
Zusammenfassung
Bioinformatiker mit umfassender Erfahrung in der NGS-Datenanalyse, Einzelzell- und Bulk-Transkriptomik sowie in der Entwicklung bioinformatischer Workflows. Erfahren in der Planung skalierbarer und reproduzierbarer Pipelines, der Integration umfangreicher Multi-Omics-Datensätze sowie der Erstellung klarer Visualisierungen für verschiedene Forschungsteams. Erfahren in der engen Zusammenarbeit mit Laborwissenschaftlern, um Biologie und Informatik zu verbinden, einschließlich Ansätzen zur Datenintegration und Visualisierung. Ich arbeite gerne in multidisziplinären Umgebungen, schätze die technischen Aspekte der Workflow-Entwicklung und Datenanalyse und engagiere mich für Teamarbeit, kontinuierliches Lernen und den Einsatz meiner Fähigkeiten, um die Wissenschaft voranzubringen und die menschliche Gesundheit zu verbessern.
Sprachen
Ausbildung
Universität São Paulo
Promotion in Biowissenschaften (Genetik) · Biowissenschaften (Genetik) · São Paulo, Brasilien
Universität São Paulo
Master in Biowissenschaften (Genetik) · Biowissenschaften (Genetik) · São Paulo, Brasilien
Universität São Paulo
Bachelor in Biowissenschaften · Biowissenschaften · São Paulo, Brasilien
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