Ravindra Garde - Postdoktorand

Recommended expert

Braunschweig, Deutschland

Erfahrungen

Juni 2023 - Juni 2025

2 Jahren 1 Monate

Braunschweig, Deutschland

Entwicklung eines agentenbasierten Modells zur Erklärung der Diskrepanz zwischen Dosierung und Aufnahme von Antibiotika in Bakterien
Förderung der Zusammenarbeit mit Mikrobiologen zur Entwicklung eines datengesteuerten Rahmens für Antibiotikadosierung

März 2022 - Dez. 2022

10 Monaten

Leipzig, Deutschland

Bewilligung des DFG Walter-Benjamin-Stipendiums, was Initiative und Engagement für die eigene Weiterentwicklung bei gleichzeitigem Beitrag zu bedeutenden Forschungsprojekten zeigt
Entwicklung einer Pipeline für Metadynamik-Simulationen mit kollektiven Variablen zur Beschreibung des Öffnungsvorgangs eines Anionenkanals
Docking eines potenziellen Therapeutikums an das Untersuchungsprotein
Beherrschung von vHTS und Enhanced-Sampling-MD-Simulationen mit PLUMED innerhalb von 3 Monaten, wodurch Workflows für Projekte in der Proteininformatik optimiert wurden
Teilnahme an kooperativen Nebenprojekten zur Modellierung der Struktur von TLR4, gebunden an ein Protein, mit AlphaFold2 Multimer
Beitrag zu RosettaCon durch Teilen von Erkenntnissen zu rechnergestützten Frameworks, Stärkung professioneller Netzwerke und Förderung innovativer Lösungen in der Strukturbiologie

Okt. 2020 - Juni 2021

9 Monaten

Jena, Deutschland

Transkriptomanalyse von Sorghum bicolor, infiziert mit zwei Formae speciales von Sporisorium reilianum
Erfolgreiche Wiederaufnahme und Abschluss eines lange stockenden Projekts
Unterstützung einer Doktorandin/eines Doktoranden bei der Analyse von Mais-Transkriptomdaten

März 2017 - Nov. 2020

3 Jahren 9 Monaten

Jena, Deutschland

Erfolgreiche Anwendung eines Minimalmodells zur Beschreibung von Biofilm-Wachstumsoszillationen und Weiterentwicklung des Modells
Aufbau von Kooperationen innerhalb der Forschungsgruppe und Mitwirkung an einem umfassenden Übersichtsartikel zur Modellierung von Wirt-Pathogen-Interaktionen
Kritische Bewertung von Projekten, Daten und Leistung, was in der Veröffentlichung in internationalen, peer-reviewten Open-Access-Fachzeitschriften resultierte
Vermittlung von Wissenschaft durch mündliche Vorträge und Posterpräsentationen auf Konferenzen
Leitung und Betreuung eines praktischen Kurses zu Stoffwechsel- und Regulationsnetzwerken für Masterstudierende in jedem Sommersemester zwischen 2018 und 2020
Betreuung der Bewerberinnen und Bewerber für die IMPRS-Promotionsprogramme in den Jahren 2017 und 2018

Hochqualifizierter Computational-biologe Mit Fortgeschrittenen Kenntnissen In Molekulardynamischen Simulationen, Ngs-datenanalyse, Systembiologie Und Virtuellem Hochdurchsatz-screening
Umfangreiche Erfahrung Und Leidenschaft Für Strukturbasierte Modellierung Von Makromolekülen
Leidenschaft Für Klinische Anwendungen Computergestützter Methoden
Erfahren In Zielorientierter Projektentwicklung Im Team Oder Eigenständig
Flexibler Und Anpassungsfähiger Profi, Der In Multikultureller Umgebung Aufblüht
Enthusiastisch In Der Vermittlung Von Wissenschaft An Unterschiedliche Zielgruppen (Z. B. Kunden & Wissenschaftler) Mündlich Und Schriftlich
Md-simulationen: Metadynamik, Gezielte Md, All-atom-md, Qm/mm
Molekulare Modellierung: Alphafold, Rosetta, Amber, Gromacs, Plumed, Discovery Studio, Pymol, Schrödinger Suite
Programmierung: Perl, Python, R, Bash
Ngs: Transkriptomanalyse, Tuxedo, Galaxy
Andere Tools: Confluence, Git, Jupyter Notebooks, Conda, Copasi, Celldesigner, Stella, Ms Office
Wetlab: Spektrophotometrie, Grundlegende Mikrobiologische Und Molekularbiologische Techniken, Grundlegende Proteinaufbereitung