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Mustafa (Safa) Karagöz

Postdoktorand

Mustafa Karagöz
Detmold, Deutschland

Erfahrungen

Juli 2023 - Juli 2025
2 Jahren 1 Monat
Bethesda, Vereinigte Staaten

Postdoktorand

National Institutes of Health (NIH), NHLBI

  • Entwickelte Peptidinhibitoren gegen UPF1 mit RFdiffusion, ProteinMPNN und AlphaFold2/3; validierte Kandidaten mittels Molekulardynamik-Simulationen
  • Durchsuchte über eine Million Verbindungen für Ataxie-Fusionsproteine mit AutoDock Vina; bestätigte die besten Treffer mittels GROMACS-MD-Simulationen
  • Entwickelte RNA-Seq-Analyse-Pipelines für Studien zum nonsense-vermittelten Abbau (NMD), einschließlich Isoform-Quantifizierung und Motifsuche
  • Modellierte Protein-RNA-Interaktionen mit AlphaFold3-Multimeren, integriert mit BioGRID/STRING-Datenbanken
  • Etablierte computergestützte Workflows für Transkriptomik und RNA-Regulation in iPSC-abgeleiteten humanen Modellen
Aug. 2019 - Mai 2023
3 Jahren 10 Monate
Braunschweig, Deutschland

Doktorand

Technische Universität Braunschweig

  • Untersuchte Virulenzfaktoren von Legionella pneumophila durch Kombination aus struktureller Biologie und Interaktomik
  • Setzte AlphaFold und Rosetta zur Modellierung von Pathogen-Wirt-Interaktionen ein; identifizierte therapeutisch angreifbare Zielstrukturen
  • Reinigte Effektorproteine und validierte Ligandenbindung mit nanoDSF und Oberflächenplasmonresonanz (SPR)
  • Wandte menschliche Lungenexplantate an, um molekulare Mechanismen mit Gewebeantworten auf Infektionen zu verknüpfen
  • Integrierte AP-MS-Proteomikdaten mit computergestützter Modellierung zur Abbildung von Wirt-Pathogen-Interaktionsnetzwerken
Apr. 2017 - Juli 2019
2 Jahren 4 Monate
İstanbul, Türkei

Wissenschaftlicher Assistent

Türkisch-Deutsche Universität

  • Entwickelte Rechenmodelle für Amyloidbildung und das Verhalten ungeordneter Proteine
  • Entwarf Peptid- und Proteinvarianten mittels Homologiemodellierung, Molekulardocking und Hochleistungsrechnen
  • Etablierte molekulare Modellierungs-Workflows zur Analyse von Proteinstruktur und -funktion
Feb. 2016 - Mai 2016
4 Monate
Türkei

Projektassistent

TÜBİTAK Marmara Technopark (MARTEK)

  • Führte pharmakologische Assays und Biosensoruntersuchungen für präklinische Wirkstofftests durch
  • Unterstützte automatisierte in-vivo- und ex-vivo-Protokolle zur Wirkstoffvalidierung
Juni 2014 - Sept. 2014
4 Monate
Portugal

Forschungspraktikant

Instituto Gulbenkian de Ciência (IGC)

  • Führte pharmakologische Assays und In-vivo-Studien an therapeutischen Kandidaten durch
  • Trug zu Pipelines in synthetischer Biologie und High-Throughput-Screening bei
Juni 2013 - Sept. 2013
4 Monate
İstanbul, Türkei

Forschungspraktikant

Bogazici University

  • Führte molekularbiologische Assays für Wirkstofftests und Validierung durch

Industrie Erfahrung

Sehen Sie, wo dieser Freiberufler den Großteil seiner beruflichen Laufbahn verbracht hat. Längere Linien stehen für umfangreichere praktische Erfahrung, während kürzere Linien auf gezielte oder projektbezogene Arbeit hindeuten.

Erfahren in Biotechnologie (9 Jahre), Pharmazeutika (4.5 Jahre) und Bildung (2.5 Jahre).

Biotechnologie
Pharmazeutika
Bildung

Geschäftsbereich Erfahrung

Die folgende Grafik bietet einen Überblick über die Erfahrungen des Freiberuflers in verschiedenen Geschäftsbereichen, berechnet anhand abgeschlossener und aktiver Aufträge. Sie zeigt die Bereiche, in denen der Freiberufler am häufigsten zur Planung, Umsetzung und Erzielung von Geschäftsergebnissen beigetragen hat.

Erfahren in Forschung und Entwicklung (9 Jahre).

Forschung und Entwicklung

Zusammenfassung

Computational-Biologe mit über 8 Jahren Erfahrung an der Schnittstelle von experimenteller Biologie und rechnergestützter Innovation. Expertise in Proteindesign, struktureller Bioinformatik und Transkriptomik, angewandt auf die Wirkstoffforschung. Erfolgreiche Projektleitung von molekularem Modellbau bis zur Validierung in humanen Modellsystemen. Nachgewiesene Fähigkeit, Multi-Omics-Daten zu integrieren, Rechen-Pipelines zu entwickeln und Ergebnisse in biologische Erkenntnisse für schwer angreifbare Zielstrukturen umzusetzen.

Fähigkeiten

Proteindesign

  • Alphafold2/3
  • Rfdiffusion
  • Proteinmpnn
  • Rosetta-suite

Strukturelle Biologie

  • Molekulardynamik
  • Pymol/chimerax
  • Gromacs

Computational-methoden

  • Python-/r-programmierung
  • Hpc-/cloud-computing
  • Bioinformatik-pipelines
  • Bash-skripting

Transkriptomik

  • Rna-seq-analyse
  • Isoform-quantifizierung
  • Motifsuche
  • Nmd-studien

Experimentelle Techniken

  • Proteinreinigung
  • Nanodsf/spr
  • Massenspektrometrie
  • Kultur Von Säugerzellen/ipscs

Spezialkenntnisse

  • Wirts-pathogen-interaktionen
  • Wirkstoffforschungs-pipelines
  • Multi-omics-integration
  • Schwer Angreifbare Zielstrukturen

Technische Fähigkeiten

  • Proteindesign: Alphafold2/3, Rfdiffusion, Proteinmpnn, Rosetta
  • Strukturanalyse: Pymol, Chimerax, Gromacs, Autodock Vina
  • Transkriptomik: Rna-seq, Isoform-quantifizierung, Motifsuche
  • Programmierung: Python, R, Bash-skripting
  • Computing: Hpc, Cloud-computing, Bioinformatik-pipelines

Sprachen

Deutsch
Muttersprache
Türkisch
Muttersprache
Englisch
Verhandlungssicher

Ausbildung

Aug. 2019 - Mai 2023

Technische Universität Braunschweig

Promotion in Biologie, Protein-Interaktion und Inhibition des L. pneumophila Mip und Immunmetabolismus · Biologie · Braunschweig, Deutschland

Okt. 2015 - Juni 2018

Gebze Technical University

M.Sc. Molekularbiologie & Genetik, Molekulare Charakterisierung und Identifizierung des Interaktionspartners des Peptidyl · Molekularbiologie & Genetik · Türkei

Okt. 2011 - Juni 2015

Gebze Technical University

B.Sc. Molekularbiologie & Genetik · Molekularbiologie & Genetik · Türkei

Profil

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Frequently asked questions

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Wo ist Mustafa ansässig?

Mustafa ist in Detmold, Deutschland ansässig.

Welche Sprachen spricht Mustafa?

Mustafa spricht folgende Sprachen: Deutsch (Muttersprache), Türkisch (Muttersprache), Englisch (Verhandlungssicher).

Wie viele Jahre Erfahrung hat Mustafa?

Mustafa hat mindestens 9 Jahre Erfahrung. In dieser Zeit hat Mustafa in mindestens 5 verschiedenen Rollen und für 6 verschiedene Firmen gearbeitet. Die durchschnittliche Dauer der einzelnen Projekte beträgt 2 Jahre und 6 Monate. Beachten Sie, dass Mustafa möglicherweise nicht alle Erfahrungen geteilt hat und tatsächlich mehr Erfahrung hat.

Für welche Rollen wäre Mustafa am besten geeignet?

Basierend auf der jüngsten Erfahrung wäre Mustafa gut geeignet für Rollen wie: Postdoktorand, Doktorand, Wissenschaftlicher Assistent.

Was ist das neueste Projekt von Mustafa?

Die neueste Position von Mustafa ist Postdoktorand bei National Institutes of Health (NIH), NHLBI.

Für welche Unternehmen hat Mustafa in den letzten Jahren gearbeitet?

In den letzten Jahren hat Mustafa für National Institutes of Health (NIH), NHLBI und Technische Universität Braunschweig gearbeitet.

In welchen Industrien hat Mustafa die meiste Erfahrung?

Mustafa hat die meiste Erfahrung in Industrien wie Biotechnologie, Pharmazeutika und Bildung.

In welchen Bereichen hat Mustafa die meiste Erfahrung?

Mustafa hat die meiste Erfahrung in Bereichen wie Forschung und Entwicklung.

In welchen Industrien hat Mustafa kürzlich gearbeitet?

Mustafa hat kürzlich in Industrien wie Biotechnologie und Pharmazeutika gearbeitet.

In welchen Bereichen hat Mustafa kürzlich gearbeitet?

Mustafa hat kürzlich in Bereichen wie Forschung und Entwicklung gearbeitet.

Was ist die Ausbildung von Mustafa?

Mustafa hat einen Doktor in Biologie from Technische Universität Braunschweig, einen Master in Molekularbiologie & Genetik from Gebze Technical University und einen Bachelor in Molekularbiologie & Genetik from Gebze Technical University.

Wie ist die Verfügbarkeit von Mustafa?

Mustafa ist sofort vollzeit verfügbar für passende Projekte.

Wie hoch ist der Stundensatz von Mustafa?

Der Stundensatz von Mustafa hängt von den spezifischen Projektanforderungen ab. Bitte verwenden Sie die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting zu planen und die Details zu besprechen.

Wie kann man Mustafa beauftragen?

Um Mustafa zu beauftragen, klicken Sie auf die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting anzufragen und Ihre Projektanforderungen zu besprechen.

Durchschnittlicher Tagessatz für ähnliche Positionen

Die Tagessätze basieren auf aktuellen Projekten und enthalten keine FRATCH-Marge.

1000
750
500
250
⌀ Markt: 820-980 €
Die angegebenen Tagessätze entsprechen der typischen Marktspanne für Freiberufler in dieser Position, basierend auf aktuellen Projekten auf unserer Plattform.
Die tatsächlichen Tagessätze können je nach Dienstalter, Erfahrung, Fachkenntnissen, Projektkomplexität und Auftragsdauer variieren.