Nhu loc thuy (Loc Thuy) T.

Doktorand in quantitativer Genetik und computergestützter Biologie

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Köln, Deutschland

Erfahrungen

Okt. 2022 - Jan. 2026
3 Jahren 4 Monaten
Deutschland

Doktorand in quantitativer Genetik und computergestützter Biologie

Universität zu Köln (CEPLAS – Exzellenzcluster für Pflanzenwissenschaften)

  • Generierung und Analyse umfangreicher RNA-Seq-Daten (>800 Proben) mit R, Python und Hochleistungsrechnern (HPC/Linux).
  • Integration von Multi-Omics-Daten (genomische, transkriptomische und phänotypische Daten); Einsatz bayesscher Ansätze und maschinellen Lernens zur Untersuchung von Genexpressionsvariationen und der Vererbung komplexer Merkmale.
  • Betreuung von B.Sc.- und M.Sc.-Studierenden in Versuchsplanung, Programmierung in R/Python/Bash, Biostatistik, Datenvisualisierung und wissenschaftlichen Präsentationen.
Okt. 2021 - Dez. 2022
1 Jahr 3 Monaten
Deutschland

M.Sc. in Biologie (Fast-Track-Ph.D.-Programm, CEPLAS)

Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf

  • Genomweite Assoziations- und Genotyp-Umwelt-Analysen durchgeführt.
  • Entwicklung von Variant-Calling-Workflows für 400 Ganzgenom-Proben.
  • Masterarbeit: Natürliche Variation der sekundären Samenruhe bei Arabidopsis thaliana (Endnote: 1,0 – Sehr gut) – später veröffentlicht in Molecular Ecology (2025).
Sept. 2017 - Juli 2021
3 Jahren 11 Monaten
Niederlande

B.Sc. in Lebenswissenschaften (Schwerpunkt Molekulare Pflanzenbiologie)

HAN Hochschule für Angewandte Wissenschaften

  • Forschungsaufenthalte während des Studiums (ERASMUS-gefördert):
  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK), Deutschland
  • Deutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung (iDiv), Deutschland
  • Glasgow Caledonian University, Schottland – Nebenfach Lebensmittelwissenschaften.

Fähigkeiten

  • Fortgeschrittener Anwender Von R (Seit Über 6 Jahren), Python (Seit Über 4 Jahren), Bash (Seit Über 3 Jahren) Und Git (Seit Über 3 Jahren).
  • Erfahrung Mit Rna-seq Sowie Wgs- Und Multi-omics-datenintegration.
  • Erfahrung In Der Entwicklung Von Bioinformatik-pipelines; Workflow-automatisierung (Slurm Hpc/snakemake), Versionskontrolle (Git/github).
  • Fundierte Kenntnisse In Statistik, Bayesscher Inferenz Und Maschinellem Lernen Für Biologische Daten.
  • Datenvisualisierung, Qc Und Reproduzierbares Reporting (Rmarkdown, Quarto).

Sprachen

Vietnamesisch
Muttersprache
Deutsch
Verhandlungssicher
Englisch
Verhandlungssicher

Ausbildung

Okt. 2022 - Jan. 2026

Universität zu Köln (CEPLAS – Exzellenzcluster für Pflanzenwissenschaften)

Doktorand · Quantitative Genetik und computergestützte Biologie · Köln, Deutschland

Okt. 2021 - Dez. 2022

Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf

M.Sc. in Biologie, Fast-Track-Ph.D.-Programm, CEPLAS · Biologie · Düsseldorf, Deutschland · 1,0 – Sehr gut

Sept. 2017 - Juli 2021

HAN Hochschule für Angewandte Wissenschaften

B.Sc. in Lebenswissenschaften, Schwerpunkt Molekulare Pflanzenbiologie · Lebenswissenschaften · Niederlande

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