Felix (Phd) Kokocinski
Direktor
Erfahrungen
Direktor
Gene-Test Bioinformatics Solutions GmbH
- Gründung und Leitung des Unternehmens zur Durchführung von Beratungsprojekten
Consultant Bioinformatiker
Gene-Test Bioinformatics Solutions GmbH
Projektarbeit in der Genominformatik, spezialisiert auf NGS-Daten und reproduktive Gesundheit, um Kunden zu ermöglichen, ihre Daten optimal zu nutzen und bessere Produkte zu entwickeln
Entwicklung eines Pipeline-Systems für die One-Click-Vorverarbeitung von Einzelzell-Sequenzierungsdaten
Ermöglichung der Optimierung des Laborprotokolls durch die Analyse von PGT-A-Daten aus der Sequenzierung embryonaler Zellen
Ad-hoc-Analysen und Entwicklung eines Analyseprozesses für NGS-Daten zur Qualitätskontrolle während der Produktentwicklung
Freiwilliger
Nature Conservation Projects
Senior Bioinformatiker
Illumina Inc.
Entwicklung von genetischen Testanwendungen für den Marktführer im Bereich Sequenzierungstechnologie
Produktentwicklung vom Laborkit bis zur Softwarelösung innerhalb der Business Unit Reproduktionsgesundheit
Senior Bioinformatiker
BlueGnome Ltd
- Entwicklung von In-vitro-Diagnosewerkzeugen für eines der am schnellsten wachsenden Biotechnologie-Start-ups in Großbritannien unter Verwendung genomischer Microarrays und Sequenzierung
Senior-Bioinformatiker (ENCODE-Datenkoordinator)
Wellcome Trust Sanger Institute
Organisation des Datenflusses für ein internationales Forschungsprojekt zur Erstellung eines Referenz-Gen-Sets für das menschliche Genom
Führung eines Senior-Bioinformatikers
Bioinformatiker (Ensembl)
Wellcome Trust Sanger Institute
- Betrieb und Verbesserung der Ensembl-Genvorhersage-Pipelines zur Annotation von Wirbeltiergenomen
Fähigkeiten
Computerbasierte
- Programmierung: Hauptsprache: Python; Weitere Sprachen (Einige Erfahrung): Perl, C/c++, Php, Java, Visual Basic, R, Ruby, Matlab, Javascript
- Datenbanken: Mysql, Sqlite, Ms Access
- Plattformen: Linux/unix, Windows, Osx, Hochleistungsrechner (Lsf/sge) Und Cloud-computing (Aws)
- Sonstiges: Cvs/svn/perforce Versionskontrolle, Das, Html, Office, Grafik, Internet- Und Bioinformatikanwendungen, Ensembl-api Und Gen-vorhersage-pipeline, Bioperl, Biopython, Verarbeitung Von Next-generation-sequenzdaten, Labware Lims, Netzwerktechnologien.
Andere Fähigkeiten
- Standardmäßige Molekularbiologische Labortechniken
- Kurse In Digitaler Bildverarbeitung, Zeitmanagement, Projektmanagement, Betriebswirtschaft.
- Ivd / Ldt Produktentwicklung Nach Iso13485 (Medizinprodukte) Qualitätskontrolle, Einschließlich Design, Risikobewertung Und Dokumentation.
- Publikationsliste Bei Pubmed: [Link]
Sprachen
Ausbildung
German Cancer Res. Centre (DKFZ) Heidelberg
Promotion, Datenmanagement und funktionale Analyse von Hochdurchsatzexperimenten · Heidelberg, Deutschland
University of Freiburg and Heidelberg
Diplom/Master, Molekularbiologie · Biologie · Heidelberg, Deutschland · 1.1
German Cancer Res. Centre (DKFZ) Heidelberg
Masterarbeit, Nachweis genomischer Ungleichgewichte mit DNA-Microarrays unter Verwendung von Sonden unterschiedlicher · Biologie · Heidelberg, Deutschland
Profil
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