Kaan Ozturk
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Erfahrungen
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Uniklinik Münster
- Leitete ein Forschungsprojekt zur Untersuchung von Faktoren, die die HPV16-Infektion in Keratinozyten mithilfe von Mikroskopie- und Omics-Ansätzen modulieren.
- Kuratierte und analysierte RNAseq- und Massenspektrometrie-Daten und führte Pfad-Analysen durch, um Zielproteine zu identifizieren.
- Verantwortlich für Betrieb, fachgerechte Wartung, Funktionalität und Anwenderschulung von Mikroskopen und FACS-Geräten.
- Betreute Master-Studierende bei ihrer Abschlussarbeit, die untersuchte, welche Rolle Zell-ECM-Interaktionen für die HPV-Anfälligkeit in Keratinozyten spielen.
Wissenschaftlicher Assistent
Yeditepe University
- Entwarf ein Projekt, um mithilfe des CRISPR-Cas-Systems in vitro die Auswirkungen von SNPs auf die metastatische Krebsentwicklung zu untersuchen.
- Bearbeitete Patientenblutproben, isolierte DNA und analysierte Mutationen mittels Gelelektrophorese.
- Unterwies und betreute Studierende in Laborpraktika der Zell- und Molekularbiologie.
- Verfasste und veröffentlichte einen Forschungsartikel zu diesem Thema in einer indexierten Fachzeitschrift.
Forschungsstipendiat
Yeditepe University
- Durchsuchte Protein-Datenbank und identifizierte aktive Zentren von Enzymen, die mithilfe von SABER eine promiskuitive Aktivität für die MBH-Reaktion zeigen könnten.
- Führte Molekulardocking an ausgewählten Proteinen mit AutoDock Vina durch.
- Führte kurze (10 ns) Molekulardynamiksimulationen in Amber12 durch, um Substrat-Ligand-Wechselwirkungen der ausgewählten Trefferproteine zu bewerten.
Zusammenfassung
Interdisziplinärer Wissenschaftler mit fundiertem Hintergrund in Molekularbiologie, Krebsbiologie, Virologie und computergestützter Chemie. Vier Jahre Erfahrung in fortgeschrittener Fluoreszenz-/Lebendzellmikroskopie, kombiniert mit ausgeprägten Bildanalysefähigkeiten mit Fiji, CellProfiler und Imaris, einschließlich Skripterstellung für Datenanalysen. Nachgewiesene Fähigkeit, komplexe Mikroskopsysteme und Durchflusszytometer zu betreiben, Anwender zu schulen und in Forschungsteams zusammenzuarbeiten. Begeistert davon, rechnerische und experimentelle Ansätze zu verbinden, um biologische Probleme mit datengetriebener Denkweise und praktischer Arbeitsweise zu lösen.
Fähigkeiten
Technische Fähigkeiten:
- Durchflusszytometrie
- Zellkultur Von Säugerzellen
- Primärkultur
- Mikroskopie (Fluoreszenz, Tirf, Konfokal, Live)
- Rnaseq-analyse
- Massenspektrometrie
- Pcr
- Sds-page
- Western-blot
- Dna/rna-extraktion
- Transfektion & Proteinexpression
- Icc
- Viruserzeugung (Psv)
- Molekulardynamiksimulationen
- Protein-docking
It-/computerkenntnisse:
- Python (Pandas)
- R
- Matlab
- Imaris
- Fiji
- Cellprofiler
- Graphpad
- Autodock Vina
- Amber Molecular Dynamics
Mikroskope:
- Dragonfly Hochgeschwindigkeits-konfokalmikroskop (Oxford Instruments)
- Ixplore Ix83/tirf (Olympus)
- Imagexpress Micro Konfokalmikroskop (Molecular Devices)
- Lsm900 Laser-konfokalmikroskop (Zeiss)
- Spinning-disk-konfokalmikroskop (Zeiss)
Soft Skills:
- Wissenschaftliche Kommunikation
- Kritisches Denken
- Projektplanung & Koordination
- Detailgenauigkeit & Methodisches Arbeiten
Sprachen
Ausbildung
Universität Münster
Promotion · Zelluläre Virologie · Münster, Deutschland
Yeditepe University
Master · Biotechnologie · İstanbul, Türkei
Yeditepe University
Bachelor, Doppelstudium · Chemieingenieurwesen · İstanbul, Türkei
Profil
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