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Nooshin Omranian

Senior Computational Biologe

Nooshin Omranian
Berlin, Deutschland

Erfahrungen

Nov. 2024 - Bis heute
1 Jahr 3 Monate
Berlin, Deutschland

Senior Computational Biologe

Max-Planck-Institut für molekulare Genetik

  • Forschung an der Schnittstelle von Proteomik und künstlicher Intelligenz, mit Schwerpunkt auf der Anwendung von Machine-Learning-Modellen (z. B. neuronale Netze, Clustering-Algorithmen und Merkmalsextraktion) zur Analyse komplexer biologischer Datensätze.
  • Entwicklung und Vermittlung KI-basierter Analyse-Workflows für molekulare und proteomische Daten, mit Tools wie Python (scikit-learn, TensorFlow, Pandas) für prädiktives Modellieren und Datenvisualisierung.
  • Zusammenarbeit mit interdisziplinären Teams zur Untersuchung datengestützter Hypothesen in der Molekulargenetik und zur Verbesserung der biologischen Interpretation durch KI-gestützte Mustererkennung.
  • Implementierung automatisierter Datenverarbeitungs-Pipelines zur Verbesserung der Reproduzierbarkeit und des FAIR Data Managements in Hochdurchsatzexperimenten.
Feb. 2024 - Bis heute
2 Jahren
Berlin, Deutschland

Senior Computational Biologe

Charité - Universitätsmedizin Berlin

  • Einsatz von Metric Learning-Ansätzen zur Identifizierung von Proteinsignaturen, die präsymptomatische Sepsis von allgemeiner Entzündung unterscheiden.
  • Entwicklung proteomischer Signaturen zur Vorhersage des Therapieansprechens und der Resistenz bei onkologischen Patienten.
  • Durchführung von Überlebensanalysen durch Integration klinischer und proteomischer Datensätze.
  • Durchführung groß angelegter Massenspektrometrie-Datenanalysen zur Unterstützung der Biomarkerentdeckung.
  • Untersuchung molekularer Mechanismen der antifungalen Arzneimittelresistenz mittels computergestützter Modellierung und Proteomik.
Feb. 2022 - Feb. 2024
2 Jahren 1 Monat
Berlin, Deutschland

Senior Computational Biologe/Machine-Learning-Wissenschaftler

Eagle Genomics

  • Entwurf und Implementierung skalierbarer Bioinformatik-Pipelines (Nextflow, Python, R) für Mikrobiom- und Multi-Omics-Analysen in Produktionsumgebungen.
  • Leitung der Integration mikrobieller Interaktionsnetzwerke und Host–Mikrobiom-Analysen.
  • Tätigkeit als Fachexperte (SME) in funktionsübergreifenden Produktentwicklungsteams.
  • Beitrag zu zwei Produkteinführungen unter Gewährleistung von Reproduzierbarkeit und Einhaltung von CI/CD-Praktiken.
Okt. 2014 - Apr. 2022
7 Jahren 7 Monate
Potsdam, Deutschland

Wissenschaftler für Computational Biology

Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie

  • Betreuung von Studierenden in unterschiedlichen Forschungsaufgaben.
  • Einsatz von Machine-Learning-Methoden zur Vorhersage des Interaktoms verschiedener Spezies und Anwendung unterschiedlicher Ansätze zur Modellauswahl.
  • Ableitung von Genregulationsnetzwerken, sowohl kontextunabhängig als auch kontextspezifisch.
  • Analyse von Omics-Datensätzen, einschließlich Transkriptexpression aus Microarray- und RNA-Seq-Technologien, Proteinabundanzen und Metabolitenleveln, sowie deren Integration.
  • Arbeit mit Git, GitHub und Weka für Machine-Learning-Analysen.
  • Anwendung fortgeschrittener Analysemethoden, darunter Netzanalyse, Zeitreihenanalyse, Segmentierung von Zeitreihendatensätzen, Identifikation von Wirkmechanismen, phylogenetische Analyse und Quantifizierung der Erblichkeit in populationsgenetischen Studien.
  • Unterstützung von Doktoranden beim Verfassen von Artikeln, Dissertationen und der Strukturierung von Präsentationen.
Sept. 2013 - Juni 2014
10 Monate
Berlin, Deutschland

Dateningenieur

LifeGlimmer GmbH

  • Durchführung umfangreicher Textmining-Analysen und Erstellung einer Datenbank aller in Publikationen verfügbaren genregulatorischen Interaktionsnetzwerke im Zusammenhang mit NF-κB.
  • Einarbeitung eines Kollegen in klassische und fortgeschrittene Netzwerkanalyse von Transkriptionsdaten.
  • Verwendung von R für alle Programmier- und Datenanalyse-Schritte.
Juni 2009 - Sept. 2010
1 Jahr 4 Monate
Potsdam, Deutschland

Forscher

Institut für Biochemie und Biologie, Universität Potsdam

  • Begann mit dem Programmieren in R.
  • Verwendete Python, Perl und SQL sowie Text-Mining-Funktionen, um alle verfügbaren Genexpressionsdatensätze im GEO zu erstellen und zu annotieren und Gene zu identifizieren, die am Signal-Crosstalk beteiligt sind.
  • Führte klassische computergestützte Analysen dieser Datensätze durch, einschließlich Differenzialverhalten, Clusterbildung und Enrichment-Analyse.

Zusammenfassung

Computational Biologe (Ph.D.) mit interdisziplinärer Erfahrung an der Charité, Eagle Genomics und am Max-Planck-Institut für molekulare Genetik. Expertise in der Integration von Multi-Omics-Daten, Proteomik und KI-gesteuerter Modellierung für translationale und prädiktive Anwendungen.

An der Charité hat er Projekte geleitet, die maschinelles Lernen und Massenspektrometrie anwenden, um proteomische Signaturen für die frühe Sepsis-Erkennung zu identifizieren, das Therapieansprechen und die Resistenz in der Onkologie vorherzusagen und antifungale Medikamentenresistenz zu charakterisieren.

Bei Eagle Genomics entwickelte er skalierbare und reproduzierbare Bioinformatik-Pipelines (Nextflow, Python, R) für die Analyse von Mikrobiom- und Multi-Omics-Daten in Produktionsumgebungen.

Derzeit am Max-Planck-Institut treibt er den Einsatz von künstlicher Intelligenz und Deep Learning in der Proteomik voran, unterrichtet KI-Methoden und entwickelt datengetriebene Modelle, um biologische Mechanismen zu erforschen.

Er ist versiert in prädiktivem Modellieren, Datenfusion, statistischer Analyse und interdisziplinärer Zusammenarbeit.

Leidenschaftlich darum bemüht, KI und computergestütztes Modellieren zu nutzen, um komplexe biologische Systeme in umsetzbare Erkenntnisse für den Gesundheitsbereich, die Biotechnologie und die Digital-Twin-Forschung zu verwandeln.

Fähigkeiten

  • Programmierung
  • Kommunikationsfähigkeiten
  • Belastbarkeit
  • Anpassungsfähigkeit
  • Schnelle Auffassungsgabe
  • Teamfähigkeit
  • Fortgeschrittene Analytische Denkfähigkeit
  • Effektives Zeitmanagement
  • Teamführung
  • Kritisches Denken Und Problemlösung
  • Multitasking-fähigkeit
  • Python
  • R
  • Datenmanagement
  • Deep Learning
  • Ki
  • Maschinelles Lernen
  • Verarbeitung Natürlicher Sprache
  • Innovation
  • Statistische Analyse
  • Zeitreihenanalyse
  • Linux

Sprachen

Deutsch
Muttersprache
Englisch
Verhandlungssicher

Ausbildung

Okt. 2010 - Sept. 2014

Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie - Institut für Biochemie und Biologie, Abteilung Molekularbiologie

PhD · Systembiologie · Potsdam, Deutschland

Okt. 2005 - Sept. 2008

Universität Shiraz

MSc · Softwaretechnik · Shiraz, Iran, Islamische Republik

Nov. 2001 - Sept. 2005

Universität Shiraz

BSc · Softwaretechnik · Shiraz, Iran, Islamische Republik

Profil

Erstellt
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Frequently asked questions

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Wo ist Nooshin ansässig?

Nooshin ist in Berlin, Deutschland ansässig.

Welche Sprachen spricht Nooshin?

Nooshin spricht folgende Sprachen: Deutsch (Muttersprache), Englisch (Verhandlungssicher).

Wie viele Jahre Erfahrung hat Nooshin?

Nooshin hat mindestens 13 Jahre Erfahrung. In dieser Zeit hat Nooshin in mindestens 5 verschiedenen Rollen und für 6 verschiedene Firmen gearbeitet. Die durchschnittliche Dauer der einzelnen Projekte beträgt 2 Jahre und 2 Monate. Beachten Sie, dass Nooshin möglicherweise nicht alle Erfahrungen geteilt hat und tatsächlich mehr Erfahrung hat.

Für welche Rollen wäre Nooshin am besten geeignet?

Basierend auf der jüngsten Erfahrung wäre Nooshin gut geeignet für Rollen wie: Senior Computational Biologe, Senior Computational Biologe/Machine-Learning-Wissenschaftler, Wissenschaftler für Computational Biology.

Was ist das neueste Projekt von Nooshin?

Die neueste Position von Nooshin ist Senior Computational Biologe bei Max-Planck-Institut für molekulare Genetik.

Für welche Unternehmen hat Nooshin in den letzten Jahren gearbeitet?

In den letzten Jahren hat Nooshin für Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Charité - Universitätsmedizin Berlin, Eagle Genomics und Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie gearbeitet.

In welchen Industrien hat Nooshin die meiste Erfahrung?

Nooshin hat die meiste Erfahrung in Industrien wie Biotechnologie, Gesundheitswesen und Bildung.

In welchen Bereichen hat Nooshin die meiste Erfahrung?

Nooshin hat die meiste Erfahrung in Bereichen wie Forschung und Entwicklung (F&E), Produktentwicklung und Informationstechnologie (IT).

In welchen Industrien hat Nooshin kürzlich gearbeitet?

Nooshin hat kürzlich in Industrien wie Biotechnologie und Gesundheitswesen gearbeitet.

In welchen Bereichen hat Nooshin kürzlich gearbeitet?

Nooshin hat kürzlich in Bereichen wie Forschung und Entwicklung (F&E), Produktentwicklung und Informationstechnologie (IT) gearbeitet.

Was ist die Ausbildung von Nooshin?

Nooshin hat einen Doktor in Systembiologie from Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie - Institut für Biochemie und Biologie, Abteilung Molekularbiologie, einen Master in Softwaretechnik from Universität Shiraz und einen Bachelor in Softwaretechnik from Universität Shiraz.

Wie ist die Verfügbarkeit von Nooshin?

Nooshin wird ab Februar 2026 vollzeit verfügbar sein.

Wie hoch ist der Stundensatz von Nooshin?

Der Stundensatz von Nooshin hängt von den spezifischen Projektanforderungen ab. Bitte verwenden Sie die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting zu planen und die Details zu besprechen.

Wie kann man Nooshin beauftragen?

Um Nooshin zu beauftragen, klicken Sie auf die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting anzufragen und Ihre Projektanforderungen zu besprechen.

Durchschnittlicher Tagessatz für ähnliche Positionen

Die Tagessätze basieren auf aktuellen Projekten und enthalten keine FRATCH-Marge.

1200
900
600
300
⌀ Markt: 850-1010 €
Die angegebenen Tagessätze entsprechen der typischen Marktspanne für Freiberufler in dieser Position, basierend auf aktuellen Projekten auf unserer Plattform.
Die tatsächlichen Tagessätze können je nach Dienstalter, Erfahrung, Fachkenntnissen, Projektkomplexität und Auftragsdauer variieren.