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Pierre Joubert

Postdoktorand

Pierre Joubert
Dresden, Deutschland

Erfahrungen

Sept. 2023 - Sept. 2025
2 Jahren 1 Monat
Dresden, Deutschland

Postdoktorand

Biomedizinisch-Genomik-Gruppe von Anna Poetsch, Dresden

  • Bewertete mehrere LLMs für genomische Vorhersageaufgaben und stellte eine gründliche Evaluation über verschiedene Architekturen und Datensätze sicher.
  • Erweiterte und optimierte die LLM-Architektur im Labor, verbesserte die Interpretierbarkeit und erweiterte ihre Einsatzmöglichkeiten.
  • Identifizierte sequenzielle und epigenetische Faktoren, die der Stabilität des menschlichen Genoms zugrunde liegen, und ermöglichte so tiefere Einblicke in ihre jeweiligen Rollen in der Genomforschung.
  • Betreute und konzipierte Projekte für mehrere Masterstudierende und Praktikanten, was zu sehr guten Bewertungen in den Abschlussberichten und zur Entwicklung laborweiter Pipelines führte.
Juni 2022 - Juli 2022
2 Monate
South San Francisco, Vereinigte Staaten

Praktikant in computergestützter Biologie

Myriad Genetics

  • Entwickelte eine optimierte Datenanalyse-Pipeline, die die diagnostische Genauigkeit bei nicht-invasiven pränatalen Tests auf fetale Aneuploidien verbesserte.
Aug. 2018 - Mai 2023
4 Jahren 10 Monate
Berkeley, Vereinigte Staaten

Doktorand

Labor von Ksenia Krasileva, University of California, Berkeley

  • Entwickelte und leitete Projekte zur Evolution pilzlicher Pflanzenpathogene und brachte damit ein neues Forschungsfeld ins Labor.
  • Entwickelte eine neue Sequenzierungs- und Analyse-Pipeline zur Detektion zirkulärer DNAs und entdeckte so einen zuvor unbekannten Aspekt der Evolution pilzlicher Pflanzenpathogene.
  • Führte eine internationale Zusammenarbeit und generierte Sequenzen für 70 neue Genome pilzlicher Pflanzenpathogene.
  • Erstellte skalierbare Pipelines für Genomassemblierung und Datenintegration, NGS-Analyse und die Entwicklung skalierbarer Workflows.
  • Identifizierte epigenetische Marker im Zusammenhang mit der Genom-Evolution pilzlicher Pflanzenpathogene und ebnete so den Weg für eine verbesserte Auswahl krankheitsresistenter Nutzpflanzen.
  • Betreute und konzipierte ein Projekt für einen studentischen Forschungsassistenten, das zu einer Co-Erstautor-Publikation führte.
Juni 2017 - Juni 2018
1 Jahr 1 Monat
Seattle, Vereinigte Staaten

Forschungswissenschaftler, Sharon Doty Lab, University of Washington

Okt. 2015 - Juni 2017
1 Jahr 9 Monate
Seattle, Vereinigte Staaten

Studentischer Forschungsassistent, Sharon Doty Lab, University of Washington

  • Entdeckte und charakterisierte pflanzenassoziierte Mikroben, die später für landwirtschaftliche Anwendungen lizenziert wurden.
  • Führte Schulungen und Beaufsichtigung von studentischen Forschenden in Molekularbiologie, Versuchsplanung und wissenschaftlichem Schreiben durch, was zu höherer Laborproduktivität und besseren Erfolgsquoten bei Stipendien führte.
  • Übernahm Materialverwaltung und Budgetplanung, wodurch Abfall und Materialkosten reduziert wurden.

Zusammenfassung

Computational Biologe mit Expertise in der Integration von Multi-Omics-Daten, NGS-Analysen und der Entwicklung skalierbarer Workflows. Versiert in Python, R, HPC und in der Kombination statistischer sowie maschineller Lernverfahren zur Gewinnung biologischer Erkenntnisse. Leidenschaftlich daran interessiert, datengetriebene Entdeckungen in Fortschritte in der Arzneimittelentwicklung und der menschlichen Gesundheit zu überführen.

Fähigkeiten

  • Reproduzierbare Datenanalyse Mit Python, R, Bash Und Git.
  • Expertenwissen In Ngs-datenanalyse Und Multi-omics.
  • Erfahrung Mit Workflow-managern (Wdl, Snakemake), Hpc- Und Cloud-umgebungen.

Sprachen

Englisch
Muttersprache
Deutsch
Grundkenntnisse

Ausbildung

Aug. 2018 - Mai 2023

University of California, Berkeley

PhD in Mikrobiologie mit ausgewiesenem Schwerpunkt in Rechnergestützter und Genomischer Biologie · Mikrobiologie · Berkeley, Vereinigte Staaten

Sept. 2013 - Juni 2017

University of Washington

B.S. Biologie (Molekular-, Zell- und Entwicklungsbiologie) · Biologie (Molekular-, Zell- und Entwicklungsbiologie) · Seattle, Vereinigte Staaten

Profil

Erstellt
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Frequently asked questions

Sie haben Fragen? Hier finden Sie weitere Informationen.

Wo ist Pierre ansässig?

Pierre ist in Dresden, Deutschland ansässig.

Welche Sprachen spricht Pierre?

Pierre spricht folgende Sprachen: Englisch (Muttersprache), Deutsch (Grundkenntnisse).

Wie viele Jahre Erfahrung hat Pierre?

Pierre hat mindestens 9 Jahre Erfahrung. In dieser Zeit hat Pierre in mindestens 5 verschiedenen Rollen und für 3 verschiedene Firmen gearbeitet. Die durchschnittliche Dauer der einzelnen Projekte beträgt 1 Jahr und 10 Monate. Beachten Sie, dass Pierre möglicherweise nicht alle Erfahrungen geteilt hat und tatsächlich mehr Erfahrung hat.

Für welche Rollen wäre Pierre am besten geeignet?

Basierend auf der jüngsten Erfahrung wäre Pierre gut geeignet für Rollen wie: Postdoktorand, Praktikant in computergestützter Biologie, Doktorand.

Was ist das neueste Projekt von Pierre?

Die neueste Position von Pierre ist Postdoktorand bei Biomedizinisch-Genomik-Gruppe von Anna Poetsch, Dresden.

Für welche Unternehmen hat Pierre in den letzten Jahren gearbeitet?

In den letzten Jahren hat Pierre für Biomedizinisch-Genomik-Gruppe von Anna Poetsch, Dresden, Myriad Genetics, Labor von Ksenia Krasileva, University of California und Berkeley gearbeitet.

In welchen Industrien hat Pierre die meiste Erfahrung?

Pierre hat die meiste Erfahrung in Industrien wie Biotechnologie, Landwirtschaft und Bildung.

In welchen Bereichen hat Pierre die meiste Erfahrung?

Pierre hat die meiste Erfahrung in Bereichen wie Forschung und Entwicklung (F&E), Informationstechnologie (IT) und Projektemanagement. Pierre hat auch etwas Erfahrung in Finanzen und Beschaffung und Einkauf.

In welchen Industrien hat Pierre kürzlich gearbeitet?

Pierre hat kürzlich in Industrien wie Biotechnologie und Landwirtschaft gearbeitet.

In welchen Bereichen hat Pierre kürzlich gearbeitet?

Pierre hat kürzlich in Bereichen wie Forschung und Entwicklung (F&E), Informationstechnologie (IT) und Projektemanagement gearbeitet.

Was ist die Ausbildung von Pierre?

Pierre hat einen Doktor in Mikrobiologie from University of California, Berkeley und einen Bachelor in Biologie (Molekular-, Zell- und Entwicklungsbiologie) from University of Washington.

Wie ist die Verfügbarkeit von Pierre?

Pierre ist sofort in Teilzeit verfügbar für passende Projekte.

Wie hoch ist der Stundensatz von Pierre?

Der Stundensatz von Pierre hängt von den spezifischen Projektanforderungen ab. Bitte verwenden Sie die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting zu planen und die Details zu besprechen.

Wie kann man Pierre beauftragen?

Um Pierre zu beauftragen, klicken Sie auf die Meet-Schaltfläche im Profil, um ein Meeting anzufragen und Ihre Projektanforderungen zu besprechen.

Durchschnittlicher Tagessatz für ähnliche Positionen

Die Tagessätze basieren auf aktuellen Projekten und enthalten keine FRATCH-Marge.

1000
750
500
250
⌀ Markt: 780-940 €
Die angegebenen Tagessätze entsprechen der typischen Marktspanne für Freiberufler in dieser Position, basierend auf aktuellen Projekten auf unserer Plattform.
Die tatsächlichen Tagessätze können je nach Dienstalter, Erfahrung, Fachkenntnissen, Projektkomplexität und Auftragsdauer variieren.