Harshita S. - Forschungsassistent

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Glasgow, Vereinigtes Königreich

Erfahrungen

Dez. 2024 - Juni 2025

7 Monaten

Forschungsassistent

Shared Research Facility, University of Glasgow

Verarbeitet und integrierte Visium Spatial-Transkriptomik-Proben mit SCTransform zur Korrektur von Batch-Effekten; dabei strenge QC-Verfahren angewendet, um niedrigqualitative Spots und fehlgeschlagene Proben auszuschließen.
Annotierte Zellcluster mit Azimuth und bekannten Markergenen, visualisierte die räumliche Verteilung auf H&E-gefärbtem Gewebe und differenzierte Tumor- von Nicht-Tumor-Regionen für regionsspezifische Analysen.
Führte Differenzanalyse der Genexpression und Pathway-Enrichment-Analyse zwischen Gruppen mit hohem und niedrigem Stress durch, um stressbedingte Veränderungen in der Tumormikroumgebung zu bewerten.

Sept. 2024 - Bis heute

1 Jahr 4 Monaten

Lehrassistent

University of Glasgow

Leitete Einzel-Laborsitzungen für Bachelor-, Master- und PhD-Studierende in diesen Kursen: Python-Programmierung und SQL-Datenbanken, R-Programmierung, Genomik und Sequenzanalyse, Transkriptomanalyse und scRNA-Analyse.
Führte Studierende bei der Erstellung von Bioinformatik-Pipelines, speziell für Next-Generation Sequencing (NGS), Transkriptomik und scRNA-Analyse.

Apr. 2022 - Feb. 2023

11 Monaten

Junior-Wissenschaftlicher Analyst

Genotypic Technology Pvt Ltd.

Entwickelte robuste Transkriptomik-Analysepipelines für Genexpressionsanalysen, steigerte deren Genauigkeit und Effizienz und erfüllte die Anforderungen nach GCP und ISO 9001:2015.
Verwaltete und führte umfassende Analysen großer Datensätze durch und erstellte Berichte mit ausführlichen biologischen Interpretationen der Ergebnisse.
Leitete die Pflege umfassender Projektdokumentation und -planung, um Klarheit und Organisation in allen Projektphasen zu gewährleisten.
Managte zugewiesene Aufgaben effizient, optimierte die Teamproduktivität und sicherte termingerechte Projektlieferungen.
Pflegte regelmäßigen Kundenkontakt, um Anforderungen zu verstehen, Updates zu geben und die Zufriedenheit mit den Ergebnissen sicherzustellen.
Annotierte manuell Krebsvarianten, sowohl somatische als auch Keimbahnvarianten, entsprechend den ACMG-Richtlinien und erhöhte so die Genauigkeit und Relevanz der genetischen Informationen für den klinischen Einsatz.

Aug. 2021 - Nov. 2021

4 Monaten

Bioinformatik-Praktikant

The Gene Box

Führte umfassende Analysen von metagenomischen und metatranskriptomischen Big Data durch, um fortgeschrittene Forschungsinitiativen zu unterstützen.
Übernahm die Datenvorverarbeitung mit Python und stellte die Datenqualität sowie Analysebereitschaft sicher.
Kuratierte manuell Krebsgenomdaten nach ACMG-Richtlinien und verbesserte so die Genauigkeit und Relevanz der genetischen Informationen für den klinischen Einsatz.

Zusammenfassung

Ich bin Bioinformatiker am Anfang meiner Karriere mit über drei Jahren Erfahrung in Wissenschaft und Industrie.

Meine Arbeit hat mein Interesse daran vertieft, rechnergestützte Methoden - insbesondere IATAC-seq- und Cloud-Workflows - einzusetzen, um genetische Mechanismen bei menschlichen Erkrankungen zu untersuchen, und ich habe gleichzeitig zu bedeutender Forschung in der Entwicklungsbiologie und Krankengenomik beigetragen.

Sprachen

Englisch

Verhandlungssicher

Ausbildung

Sept. 2023 - Sept. 2024

University of Glasgow

Master in Bioinformatik · Bioinformatik · Glasgow, Vereinigtes Königreich · Gut

Juli 2016 - Juli 2021

KIIT School of Biotechnology

Integrierter Bachelor und Master in Biotechnologie · Biotechnologie · Indien · Mit Auszeichnung

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