Harshita S.
Forschungsassistent
Erfahrungen
Dez. 2024 - Juni 2025
7 MonatenForschungsassistent
Shared Research Facility, University of Glasgow
- Verarbeitet und integrierte Visium Spatial-Transkriptomik-Proben mit SCTransform zur Korrektur von Batch-Effekten; dabei strenge QC-Verfahren angewendet, um niedrigqualitative Spots und fehlgeschlagene Proben auszuschließen.
- Annotierte Zellcluster mit Azimuth und bekannten Markergenen, visualisierte die räumliche Verteilung auf H&E-gefärbtem Gewebe und differenzierte Tumor- von Nicht-Tumor-Regionen für regionsspezifische Analysen.
- Führte Differenzanalyse der Genexpression und Pathway-Enrichment-Analyse zwischen Gruppen mit hohem und niedrigem Stress durch, um stressbedingte Veränderungen in der Tumormikroumgebung zu bewerten.
Sept. 2024 - Bis heute
1 Jahr 3 MonatenLehrassistent
University of Glasgow
- Leitete Einzel-Laborsitzungen für Bachelor-, Master- und PhD-Studierende in diesen Kursen: Python-Programmierung und SQL-Datenbanken, R-Programmierung, Genomik und Sequenzanalyse, Transkriptomanalyse und scRNA-Analyse.
- Führte Studierende bei der Erstellung von Bioinformatik-Pipelines, speziell für Next-Generation Sequencing (NGS), Transkriptomik und scRNA-Analyse.
Apr. 2022 - Feb. 2023
11 MonatenJunior-Wissenschaftlicher Analyst
Genotypic Technology Pvt Ltd.
- Entwickelte robuste Transkriptomik-Analysepipelines für Genexpressionsanalysen, steigerte deren Genauigkeit und Effizienz und erfüllte die Anforderungen nach GCP und ISO 9001:2015.
- Verwaltete und führte umfassende Analysen großer Datensätze durch und erstellte Berichte mit ausführlichen biologischen Interpretationen der Ergebnisse.
- Leitete die Pflege umfassender Projektdokumentation und -planung, um Klarheit und Organisation in allen Projektphasen zu gewährleisten.
- Managte zugewiesene Aufgaben effizient, optimierte die Teamproduktivität und sicherte termingerechte Projektlieferungen.
- Pflegte regelmäßigen Kundenkontakt, um Anforderungen zu verstehen, Updates zu geben und die Zufriedenheit mit den Ergebnissen sicherzustellen.
- Annotierte manuell Krebsvarianten, sowohl somatische als auch Keimbahnvarianten, entsprechend den ACMG-Richtlinien und erhöhte so die Genauigkeit und Relevanz der genetischen Informationen für den klinischen Einsatz.
Aug. 2021 - Nov. 2021
4 MonatenBioinformatik-Praktikant
The Gene Box
- Führte umfassende Analysen von metagenomischen und metatranskriptomischen Big Data durch, um fortgeschrittene Forschungsinitiativen zu unterstützen.
- Übernahm die Datenvorverarbeitung mit Python und stellte die Datenqualität sowie Analysebereitschaft sicher.
- Kuratierte manuell Krebsgenomdaten nach ACMG-Richtlinien und verbesserte so die Genauigkeit und Relevanz der genetischen Informationen für den klinischen Einsatz.
Zusammenfassung
Ich bin Bioinformatiker am Anfang meiner Karriere mit über drei Jahren Erfahrung in Wissenschaft und Industrie.
Meine Arbeit hat mein Interesse daran vertieft, rechnergestützte Methoden - insbesondere IATAC-seq- und Cloud-Workflows - einzusetzen, um genetische Mechanismen bei menschlichen Erkrankungen zu untersuchen, und ich habe gleichzeitig zu bedeutender Forschung in der Entwicklungsbiologie und Krankengenomik beigetragen.
Sprachen
Englisch
VerhandlungssicherAusbildung
Sept. 2023 - Sept. 2024
University of Glasgow
Master in Bioinformatik · Bioinformatik · Glasgow, Vereinigtes Königreich · Gut
Juli 2016 - Juli 2021
KIIT School of Biotechnology
Integrierter Bachelor und Master in Biotechnologie · Biotechnologie · Indien · Mit Auszeichnung
Sie suchen Freelancer?Passende Kandidaten in Sekunden!
FRATCH GPT testenWeitere Aktionen
Ähnliche Freelancer
Entdecken Sie andere Experten mit ähnlichen Qualifikationen und Erfahrungen.
- English
- Deutsch
2025 © FRATCH.IO GmbH. All rights reserved.