Vijendra K. - Gastdozent

Pune, Indien

Erfahrungen

März 2023 - Juli 2025

2 Jahren 5 Monaten

Pune, Indien

Gastdozent

Dept. of Bioinformatics, SPPU

Lehrplanentwicklung, Vorlesungen, Leistungsbewertung und akademische Betreuung im Bereich metabolische Modellierung und Systembiologie.
Entwicklung und Implementierung eines Postgraduierten-Curriculums in metabolischer Modellierung und Systembiologie.
Durchführung umfassender Vorlesungen zu Modellen auf Genomskala, Stoffflussbilanzanalyse (FBA) und systemweitem Stamm-Engineering.
Durchführung ausführlicher Fallstudien zu Anwendungen der Systembiologie im Stamm-Engineering.
Leitung interaktiver Sitzungen zur Vertiefung des Verständnisses und zur Anwendung metabolischer Modellierungstechniken.
Bewertung der Leistungen der Studierenden durch Aufgaben und Projekte, verbunden mit konstruktivem Feedback.
Erweiterung des Wissens und der Fähigkeiten der Studierenden in metabolischer Modellierung und Systembiologie und somit Schaffung einer soliden Basis für Karrierewege in der Biotechnologie.
Erfolgreiche Vermittlung fortgeschrittener Techniken wie Modellen auf Genomskala und FBA, um die Kompetenz im systemweiten Stamm-Engineering zu steigern.

März 2022 - Bis heute

3 Jahren 10 Monaten

Pune, Indien

Leitender Projektmitarbeiter

CSIR-NCL

Entwicklung glioblastomspezifischer Stoffwechselmodelle zur Identifizierung potenzieller synthetischer letaler Genziele.
Mitarbeit an SARS-CoV-2-Genomsequenzierung mit Nanopore-Pipelines mit Schwerpunkt auf Linienbestimmung und Identifikation mutationaler Hotspots.
Anwendung der Flux-Balance-Analyse (FBA) mit der COBRA Toolbox zur Modellierung des lungen-spezifischen Metabolismus indischer Probanden und der SARS-CoV-2-Wirt-Interaktionen.
Engineering von Pseudomonas fluorescens-Stämmen zur Steigerung der Biokonversion von Ferulasäure zu Vanillin.
Erstellung von Stoffwechselmodellen mit transkriptomischen Einschränkungen für die Penicillin-V-Produktion in gentechnisch veränderten Mikroben.
Einsatz von Bioinformatik-Tools zur Analyse von Sequenzdaten, Data Mining und Datenbankverwaltung.
Identifizierung potenzieller therapeutischer Ziele für Glioblastom und Beitrag zur Krebsforschung.
Beitrag zum Verständnis der SARS-CoV-2-Epidemiologie durch Identifikation wichtiger Mutationen und Linien.
Steigerung der Effizienz von Biokonversionsprozessen und Verbesserung der Produktion wertvoller Verbindungen.
Erfolgreiches Engineering von P. fluorescens-Stämmen.

Jan. 2014 - Feb. 2021

7 Jahren 2 Monaten

Mumbai, Indien

Doktorand

IIT Bombay

Untersuchung der Genregulation und Epistase im Melibiose-Stoffwechsel von Saccharomyces cerevisiae.
Einsatz von Mutantenstammbibliotheken, Transformationstechniken und Kreuzungsassays zur Validierung regulatorischer Modelle.
Entwicklung von ODE-basierten mathematischen Modellen zur Simulation der Dynamik von Glukose-Galaktose- und Melibiose-Stoffwechselwegen sowie genetischer Schalter.
Durchführung von Sensitivitätsanalysen zur Identifizierung von Parametern, die Stoffwechselwege beeinflussen.
Durchführung von Datenanalysen und Interpretation experimenteller Ergebnisse.
Dokumentation der Forschungsergebnisse und Mitarbeit bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen.
Validierung mehrerer regulatorischer Modelle und Aufdeckung wichtiger regulatorischer Einblicke in den Melibiose-Stoffwechsel.
Aufbau und Test von ODE-basierten mathematischen Modellen.
Aufklärung sensitiver Parameter, die die Dynamik von Stoffwechselwegen beeinflussen, zur Information genetischer Engineering-Strategien.

Jan. 2014 - Juni 2016

2 Jahren 6 Monaten

Mumbai, Indien

Lehrassistent

Dept. of Biosciences & Bioengineering, IIT Bombay

Durchführung von Laborübungen und Unterstützung bei Kursgestaltung, Studentenbetreuung und Leistungsbewertung.
Durchführung praktischer Laborsitzungen für Bachelor- und Masterkurse in Hefemolekularbiologie.
Vorbereitung und Durchführung praktischer Demonstrationen für Kurse in mikrobieller Physiologie.
Unterstützung bei Planung und Durchführung synthetischer Biologie-Experimente.
Betreuung von Studierenden bei experimentellen Techniken und Datenanalyse.
Bewertung von Studierendenarbeiten und Erteilung konstruktiven Feedbacks.
Förderung der Fähigkeiten und des Verständnisses der Studierenden durch praktische Laborübungen.
Unterstützung eines effektiven Lernens komplexer Themen in Molekularbiologie, mikrobieller Physiologie und synthetischer Biologie.

Nov. 2011 - Jan. 2014

2 Jahren 3 Monaten

Pune, Indien

Projektassistent

CSIR-NCL

Isolierung mikrobieller Stämme zur Terpenproduktion in Adlerholz.
Charakterisierung flüchtiger Öle und Fermentationsprodukte.
Durchführung routinemäßiger Laborverfahren wie Medienvorbereitung und Sterilisation.
Verwaltung des Bestands an Laborverbrauchsmaterialien und -geräten.
Unterstützung bei Datenerhebung und -analyse für Experimente.
Mitwirkung bei der Identifizierung mikrobieller Stämme mit Terpenproduktion.
Mitwirkung an der umfassenden Charakterisierung flüchtiger Ölprofile.
Unterstützung bei der Instandhaltung und Wartung der Laborinfrastruktur.

Juni 2010 - Aug. 2011

1 Jahr 3 Monaten

Pune, Indien

M.Sc.-Abschlussprojekt

Universität Pune

Charakterisierte einen marinen Rhamnolipid-Biosurfaktant von Pseudomonas aeruginosa.
Bewertete die antimikrobiellen Eigenschaften des Rhamnolipid-Biosurfaktants.
Bewertete die antidiabetischen Aktivitäten des Rhamnolipid-Biosurfaktants.
Analysierte die oberflächenaktiven Eigenschaften des Rhamnolipid-Biosurfaktants.
Lieferte eine umfassende Charakterisierung des Rhamnolipid-Biosurfaktants, die potenziell zu neuen Anwendungen führen könnte.
Demonstrierte antimikrobielle und antidiabetische Eigenschaften.
Erläuterte das oberflächenaktive Verhalten des charakterisierten Biosurfaktants.

Zusammenfassung

Ph.D. in Bio- und Bioningenieurwissenschaften mit Forschungserfahrung in Systembiologie, metabolischen Modellen auf Genomskala und datengetriebener biologischer Analyse. Aktive Weiterentwicklung meiner Fähigkeiten in Python und maschinellem Lernen, um meine Expertise im COBRA-basierten Modeling zu ergänzen. Motiviert, zur Modellierungsplattform des Unternehmens beizutragen, Innovation zu fördern, wissenschaftliche Strenge sicherzustellen und von funktionsübergreifenden F&E-Teams zu lernen.

Fähigkeiten

Expertise In Der Entwicklung Und Anwendung Von Metabolischen Modellen Auf Genomskala (Gems) Mithilfe Der Cobra Toolbox Und Cobrapy Für Verschiedene Systeme, Einschließlich Säuger Und Mikroorganismen.
Erfahren In Der Integration Von Transkriptomdaten In Gems Zur Verbesserung Von Flussvorhersagen Und Modellgenauigkeit.
Praktische Erfahrung In Der Sars-cov-2-genomsequenzierung Mit Nanopore-pipelines, Einschließlich Flye, Rna-seq, Medaka, Multiqc Und Pangolin.
Geschickt Im Stamm-engineering Von Mikroorganismen Zur Steigerung Der Biokonversion Und Produktbildung.
Umfassende Kenntnisse In Matlab-programmierung Und Python Für Datenanalyse, Modellierung Und Simulation.
Nachgewiesene Fähigkeit, Graduate-kurse Im Bereich Metabolische Modellierung Und Systembiologie Zu Entwerfen Und Durchzuführen.
Erfahren In Der Anwendung Von Fba, Fva, Optknock Und Gendeletionsanalysen Zur Optimierung Von Stoffflüssen Und Zur Untersuchung Synthetischer Letalität.
Starke Grundlage In Molekularbiologie, Mikrobieller Physiologie Und Synthetischer Biologie Durch Lehr- Und Forschungserfahrung.
Python
Matlab
Nextflow
Metabolische Modellierung
Fba
Cobrapy
Cobra Toolbox
Kommunikation
Zusammenarbeit
Problemlösung
Anpassungsfähigkeit
Analytisches Denken
Prädiktive Modellierung
Genomdatenanalyse
Systembiologie
F&e-zusammenarbeit
Prozessoptimierung
Statistische Analyse
Experimentelle Biologie
Hefestoffwechseltechnik
Mikrobielles Wachstum Und Physiologie
Mikro-fermentation Und Automatisierung

Sprachen

Englisch

Verhandlungssicher

Hindi

Verhandlungssicher

Marathi

Verhandlungssicher

Ausbildung

Okt. 2014 - Juni 2021

Erfahrungen

Gastdozent

Dept. of Bioinformatics, SPPU

Leitender Projektmitarbeiter

CSIR-NCL

Doktorand

IIT Bombay

Lehrassistent

Dept. of Biosciences & Bioengineering, IIT Bombay

Projektassistent

CSIR-NCL

M.Sc.-Abschlussprojekt

Universität Pune

Zusammenfassung

Fähigkeiten

Sprachen

Ausbildung

Indian Institute of Technology Bombay

Ph.D. in Bio- und Bioningenieurwissenschaften · Bio- und Bioningenieurwissenschaften · Mumbai, Indien

University of Pune

M.Sc. in Mikrobiologie · Mikrobiologie · Pune, Indien

Modern College of Science, Pune University

B.Sc. in Mikrobiologie · Mikrobiologie · Pune, Indien

Zertifikate & Bescheinigungen

Data Science und Machine Learning (DSML)

MIT Professional Education

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Doktorand in quantitativer Genetik und computergestützter Biologie

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