CpHMD-Container - ein stochastischer konstant-pH-Molekulardynamik-Container, der allen zur Verfügung steht. (Manuskript in Vorbereitung)
Verbesserung der Schätzung der pKa-Werte aller titrierbaren Aminosäuren an der Wasser-/Membran-Grenzfläche (im Begutachtungsprozess)
Hin zur genauen Vorhersage pH-abhängiger Bindungskonstanten mittels molekularem Docking und konstant-pH-MD-Berechnungen.
Konstant-pH-MD-Simulationen des Protonierungsgetriggerten Konformationswechsels in der Translokationsdomäne des Diphtherietoxins
Eine neuartige Kombinationsbehandlung gegen CDDP-resistenten nicht-kleinzelligen Lungenkrebs basierend auf einer Ruthenium(II)-Cyclopentadienyl-Verbindung
Oberflächendynamik und Wachstumsmodi von B2-Mikroglobulin-Dimeren
Bekämpfung der Mehrfachresistenz mit Ruthenium-Cyclopentadienyl-Verbindungen: Aufdeckung des Mechanismus der P-gp-Hemmung
Histidin-Protonierung und Konformationswechsel in der Translokationsdomäne des Diphtherie-Toxins
MembIT - ein Tool zur Berechnung von Soluteinlagerungen und Membranverformungen in Molekulardynamiksimulationen
Neues US-CpHMD-Protokoll zur Untersuchung des protonierungsabhängigen Mechanismus des ATP/ADP-Transporters
Vorhersage stabiler Bindungsmodi aus simulierten Dimeren des D76N-Mutanten von B2-Mikroglobulin
pKa-Berechnungen an Membranproteinen in Methods in Molecular Biology: Computational Design of Membrane Proteins, Band 2315, Herausgeber: Irina Moreira, Joana Mourão, Miguel Machuqueiro. Im Druck.
Verbesserte GROMOS-54A7-Ladungssätze für phosphorylierte Tyr, Ser und Thr zur Behandlung pH-abhängiger Bindungsphänomene
Computational-Biochemiker, derzeit im Machuqueiro Computational Biophysics Lab tätig, spezialisiert auf konstant-pH-MD, erweiterte Sampling-Methoden, Membranbiophysik und KI-gestütztes Peptid-/Arzneimitteldesign.
Erfahren in der Anwendung rechnergestützter Techniken bei gesundheitsbezogenen Fragestellungen, der Entwicklung von Kraftfeldern und interdisziplinärer Zusammenarbeit zwischen Computer- und Nasslaborteams.
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