Raunak (Singh) S.
MSc-Forschung: Atomistische Untersuchung der Konformationsdynamik des ADPDK-Membranproteins
Erfahrungen
MSc-Forschung: Atomistische Untersuchung der Konformationsdynamik des ADPDK-Membranproteins
University College Dublin
Untersuchung der strukturellen und funktionellen Dynamik des PC1-PC2-(Polycystin)-Ionenkanals, der an ADPKD beteiligt ist.
Durchführung von Homologiemodellierung und Molekulardynamik-Simulationen, um Konformationszustände und Wirkstoffbindungsverhalten zu untersuchen.
Einsatz von NAMD und VMD in Simulations-Workflows mit Python-Skripten zur Trajektorienanalyse, Eigenschaftsextraktion und Markov-Modell-Analyse.
Ziel, biologisch relevante Einblicke in die Funktion des Kanals, die freie Bindungsenergie und potenzielle therapeutische Ziele durch atomistische Modellierung und Docking-Simulationen zu gewinnen.
Erfahrung im Umgang mit FASTA-Datenformaten sowie mit Skript-Tools zum Parsen, Analysieren und Visualisieren von Ergebnissen mit pandas, Matplotlib und Plotly.
Master of Science in Computational Physics
University College Dublin
- Relevante Kurse: Computational Biophysics und Nanoskalensimulationen, Bioinformatik, MATLAB- und R-Programmierung, Physikalische Datenanalyse mit Python, Maschinelles Lernen
Systems Engineer (Entwickler)
Tata Consultancy Services Limited
Entwickelte skalierbare Java- und PLSQL-basierte Module für eine große Versicherungsproduktplattform zur Optimierung der Schadensbearbeitung.
Entwarf und optimierte komplexe SQL-Abfragen, Stored Procedures und Trigger zur Gewährleistung robuster Anwendungsfunktionalität.
Konzipierte und implementierte eine Backend-Batch-Automatisierung, die die Benutzererfahrung und Systemreaktionsfähigkeit verbesserte und die Produktivität um 20 % steigerte.
Zusammenarbeit in funktionsübergreifenden Teams mit Stakeholdern, dabei starke Kommunikationsfähigkeit, Teamarbeit und Verantwortungsbewusstsein unter Beweis gestellt.
Bachelor of Engineering in Electronics and Telecommunication
Ramrao Adik Institute Of Technology (under University of Mumbai)
- Akademische Auszeichnungen: 10 CGPA in Ingenieurmathematik, Datenstrukturen & Algorithmen und Programmierung
Zusammenfassung
Kürzlich abgeschlossener MSc in Computational Physics (CGPA 3.91) mit Fachkenntnissen in wissenschaftlichem Rechnen, Molekülmodellierung und datengetriebener biomedizinischer Forschung. Erfahren in Proteindynamik-Simulationen, Markov-Modellierung und Python-basierter Datenanalyse, mit solider Grundlage in interdisziplinärer Problemlösung und nachweislichen Erfolgen in industrieorientierter Softwareentwicklung.
Fähigkeiten
Wissenschaftliches Rechnen: Hochleistungsrechnen, Slurm, Molekulardynamik (Namd/vmd), Protein-docking (Patchdock, Autodock), Homologiemodellierung, Alphafold, Sequenzanalyse & -Ausrichtung, Markov-modellierung, Proteinfunktionsvorhersage
Programmiersprachen: Python, Sql, C, C++, Java, Javascript, Nodejs, Reactjs
Tools & Technologien: Matlab, Git, Plsql, Java, Batch-verarbeitung, R, Unix, Docker (Grundlagen), Linux, Tensorflow, Pytorch
Cloud-computing/devops-erfahrung: Grundkenntnisse In Aws Ec2 & S3 (Anwendungsfälle Im Projekt), Git-basierte Ci/cd, Linux
Sprachen
Ausbildung
University College Dublin
Master of Science in Computational Physics · Rechenphysik · Dublin, Irland · 3.91/4.2
Ramrao Adik Institute Of Technology (under University of Mumbai)
Bachelor of Engineering in Electronics and Telecommunication · Elektrotechnik und Telekommunikation · Mumbai, Indien · 8.63/10.00
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